El Parque Yasuní está habitado principalmente por indígenas Huaorani y Kichwas.

La cultura Huaorani vivía tradicionalmente de la caza, recolección y agricultura semi-nómada en la selva, entre los ríos Napo y Curaray. Desde 1956 la mayor parte de los Huaoranis adquirieron una vida sedentaria en protectorados organizados por el Instituto Lingüístico de Verano.

Los Tagaeri y Taromenane han rehusado el contacto con la cultura occidental, y son actualmente los dos únicos pueblos conocidos y no contactados del Ecuador.

La supervivencia de estas culturas está amenazada por la actividad petrolera en el Campo ITT.